Biologia Sistêmica de Microorganismos
Nosso grupo de pesquisa tem como objetivo entender e modelar as interações moleculares que definem os microorganismos, buscando compreendê-los de forma global. Para isso, utilizamos a abordagem da Biologia Sistêmica (Systems Biology): a partir da obtenção de dados experimentais em larga-escala (genoma, transcriptoma, proteoma, etc) utilizamos ferramentas de bioinformática para analisar e integrar dados experimentais, levando a formulação de um modelo capaz de descrever e prever o comportamento da célula. A integração e exploração dos dados leva a formulação de hipóteses que serão testadas experimentalmente – validando ou refutando o modelo proposto, de forma iterativa. Para que este ciclo iterativo seja realizado, é necessária a colaboração interdisciplinar entre a Biologia, Computação e Matemática.
Para entender um organismo como um todo, estamos utilizando o microorganismo Halobacterium salinarum NRC-1 como modelo. Este procarioto unicelular vive em condições extremas de salinidade, possui um genoma compacto, e é facilmente cultivado e manipulado em laboratório. Este extremófilo possui características interessantes para aplicações biotecnológicas, estudos em astrobiologia e vem se tornando um organismo modelo no domínio Archaea no contexto da Biologia Sistêmica, culminando na elaboração de um modelo para a rede de regulação gênica global.